Aufbauend auf den bereits seit 2002 etablierten Strukturen zur Ausbildung von muslimischen Religionslehrern für den islamischen Religionsunterricht und dem 2008 gegründeten Zentrum für Interkulturelle Islamstudien erfolgt zum Wintersemester 2011/12 die Einrichtung des Instituts für Islamische Studien.

Dieses Institut soll neben dem Ausbau der bereits genannten Aktivitäten insbesondere der Förderung des wissenschaftlichen Nachwuchses in Islamischen Studien und Islamischer Theologie dienen und ein wissenschaftlich fundiertes Studium für angehende muslimische Theologen bzw. Gemeindepädagogen und Seelsorger anbieten. Dabei geht es vor allem um die Konstituierung einer wissenschaftlich fundierten Islamischen Theologie im europäischen Kontext, z.B. durch die Vermittlung der Kompetenz zur methodisch fundierten Reflexion der islamischen Quellen, die wissenschaftlichen Ansprüchen genügt. In diesem Zusammenhang soll mithilfe der Förderung des Bundesministeriums für Forschung und des Landes Niedersachsen in den nächsten fünf Jahren durch die Einstellung von Forschungsprofessoren wissenschaftliches Personal ausgebildet und somit die wissenschaftlich-rationale Reflexion des Islams in Deutschland erstmalig gewährleistet werden.